——習(xí)近平總書(shū)記在致中國(guó)科學(xué)院建院70周年賀信中作出的“兩加快一努力”重要指示要求
——中國(guó)科學(xué)院辦院方針
語(yǔ)音播報(bào)
葡萄糖是能效最高的單糖,微生物對(duì)它“情有獨(dú)鐘”。在葡萄糖存在的情況下,微生物就不愛(ài)“吃”其他的糖類(lèi),而優(yōu)先代謝葡萄糖。這種微生物特有的本領(lǐng)叫作“葡萄糖抑制”。
近期,中科院微生物所真菌學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員白逢彥領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì)在研究釀酒酵母時(shí),發(fā)現(xiàn)有一種馬奶酒酵母放棄了這項(xiàng)“絕活”。他們發(fā)現(xiàn)并證實(shí)這種酵母出現(xiàn)了“返祖”現(xiàn)象,它獲得生存競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)的策略也不同尋常。該成果日前在線(xiàn)發(fā)表于《現(xiàn)代生物學(xué)》。
一種不走尋常路的酵母
距今1.5億~1.25億年,由于有花植物的大量出現(xiàn),微生物開(kāi)始通過(guò)有氧發(fā)酵快速高效地利用前者花蜜和果實(shí)中提供的大量糖類(lèi)。在眾多糖類(lèi)中,葡萄糖能效最高,因此哪種微生物能更高效地吸收葡萄糖,通常它就具備了更強(qiáng)的生存優(yōu)勢(shì)。
在這種情況下,葡萄糖抑制機(jī)制應(yīng)運(yùn)而生。很多微生物寧肯抑制對(duì)其他糖類(lèi)的代謝能力,也要“擠破頭”地爭(zhēng)奪葡萄糖。
然而,白逢彥等人在研究馬奶酒酵母時(shí),意外地發(fā)現(xiàn)這種酵母很獨(dú)特。在葡萄糖和半乳糖同時(shí)存在的培養(yǎng)基中,與其他菌株優(yōu)先利用葡萄糖,等葡萄糖完全耗盡后,經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的延滯期再開(kāi)始利用半乳糖的現(xiàn)象相反,馬奶酒菌株在生長(zhǎng)起始期就優(yōu)先利用半乳糖,然后同時(shí)利用這兩種糖進(jìn)行生長(zhǎng)。
“這一奇怪現(xiàn)象讓我們下意識(shí)地思考,是不是半乳糖相對(duì)于葡萄糖有什么優(yōu)勢(shì)呢?”文章第一作者、中科院微生物所助理研究員段守富說(shuō)。
但很明顯,這是一個(gè)死胡同,因?yàn)槠咸烟鞘枪J(rèn)能效最高的單糖。憑借對(duì)微生物糖酵解以及酵母菌進(jìn)化的豐富了解,白逢彥認(rèn)為應(yīng)該在這種酵母體內(nèi)找原因。他們隨即將研究方向集中在馬奶酒酵母體內(nèi)半乳糖代謝(GAL)基因網(wǎng)絡(luò)的變化上。
自廢“武功”
GAL網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)研究基因調(diào)控的經(jīng)典網(wǎng)絡(luò),包括半乳糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、編碼半乳糖酵解酶的結(jié)構(gòu)基因、上述結(jié)構(gòu)基因的激活因子和抑制因子這一對(duì)“開(kāi)關(guān)”,以及解除抑制因子作用的誘導(dǎo)因子。
白逢彥告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》,在經(jīng)典的葡萄糖抑制通路中,只有在葡萄糖被耗盡而半乳糖存在的情況下,GAL網(wǎng)絡(luò)才通過(guò)誘導(dǎo)因子激活,開(kāi)始對(duì)半乳糖的代謝過(guò)程。
段守富等發(fā)現(xiàn),馬奶酒譜系菌株在結(jié)構(gòu)基因的上游抑制序列發(fā)生了突變,從而減弱了中心抑制因子的作用。抑制因子本身也發(fā)生突變,失去了抑制功能。
由于抑制因子功能喪失,作用于該抑制因子的誘導(dǎo)因子也就失去了意義,GAL網(wǎng)絡(luò)成為一個(gè)無(wú)須誘導(dǎo)的組成型表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。在這種網(wǎng)絡(luò)中,馬奶酒菌株無(wú)須經(jīng)過(guò)一個(gè)延誤時(shí)機(jī)的誘導(dǎo)期,就可以即時(shí)利用乳糖被降解后生成的半乳糖。
同時(shí),馬奶酒譜系菌株通過(guò)基因漸滲將其所有的結(jié)構(gòu)基因置換為早期版本,供體是位于釀酒酵母屬之外的一個(gè)已滅絕或尚未被發(fā)現(xiàn)的古老物種。
在馬奶酒菌株中,“返祖”后的半乳糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因擴(kuò)增,而主要的葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因卻被刪除或失去表達(dá)能力,其功能被半乳糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白所替代。
這一系列變化使馬奶酒酵母的GAL網(wǎng)絡(luò)完全解除了葡萄糖抑制效應(yīng),并通過(guò)“返祖”拋棄了漫長(zhǎng)進(jìn)化養(yǎng)成的“專(zhuān)業(yè)分工”,看來(lái)是鐵了心要自廢“武功”了。
然而,馬奶酒酵母真的是“佛系”的嗎?
“另辟蹊徑”的競(jìng)爭(zhēng)策略
為了回答這個(gè)問(wèn)題,白逢彥等人培育出含有不同GAL基因的人工釀酒酵母菌株,反復(fù)實(shí)驗(yàn)不同糖類(lèi)環(huán)境下各種酵母對(duì)糖分的利用效率,研究并繪制生長(zhǎng)曲線(xiàn),終于理解了馬奶酒酵母的 “另類(lèi)”競(jìng)爭(zhēng)策略。
原來(lái),在自然發(fā)酵乳制品中,釀酒酵母并不能利用奶中的主要碳源乳糖,只能靠利用其他微生物將乳糖降解后產(chǎn)生的葡萄糖和半乳糖而生存。
“在大多數(shù)微生物都存在葡萄糖抑制效應(yīng)的情況下,都會(huì)優(yōu)先爭(zhēng)搶葡萄糖,導(dǎo)致對(duì)葡萄糖的過(guò)度競(jìng)爭(zhēng),而半乳糖被暫時(shí)閑置?!卑追陱└嬖V《中國(guó)科學(xué)報(bào)》,“如果反過(guò)來(lái),避開(kāi)對(duì)葡萄糖的競(jìng)爭(zhēng),優(yōu)先利用半乳糖,建立群體優(yōu)勢(shì)后再參與對(duì)葡萄糖的爭(zhēng)奪,在發(fā)酵乳環(huán)境中無(wú)疑是一個(gè)具有巨大優(yōu)勢(shì)的生存策略?!?/p>
正是遵循了這種策略,馬奶酒酵母選擇避開(kāi)葡萄糖抑制網(wǎng)絡(luò),以“時(shí)刻準(zhǔn)備著”的態(tài)度大大提高了對(duì)半乳糖的利用效率。
同時(shí),馬奶酒酵母也沒(méi)有為了半乳糖而拋棄利用葡萄糖,而是通過(guò)獲取早期版本的半乳糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白達(dá)到在快速優(yōu)先利用半乳糖的情況下同時(shí)利用葡萄糖的目的。
白逢彥認(rèn)為,他們的發(fā)現(xiàn)可為同時(shí)利用不同碳源的酵母細(xì)胞工廠(chǎng)或工程菌的構(gòu)建提供新的策略,通過(guò)解除葡萄糖抑制,提高發(fā)酵效率。
“小小的酵母給了我們?nèi)绱硕嗟膯l(fā)和靈感。我們?cè)诟袊@它們的生存智慧之余,由衷地期盼它們能在工業(yè)領(lǐng)域早日迸發(fā)出能量,迎來(lái)無(wú)限前景?!卑追陱┱f(shuō)。
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